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Un equipo de investigadores del CONICET y de la Universidad Nacional de General San Martín (UNSAM) logró un avance significativo en la lucha contra la enfermedad de Chagas mediante la creación de GCanner, un software bioinformático diseñado para estudiar la estructura genética del Trypanosoma cruzi. Esta patología afecta actualmente a alrededor de 1,3 millones de personas en Argentina y a entre 6 y 7 millones a nivel global, con un saldo anual de cerca de 10 mil fallecimientos. Los detalles de este desarrollo fueron difundidos a través de la revista especializada Methods in Molecular Biology.
La herramienta informática actúa como un escáner molecular capaz de visibilizar la compleja arquitectura del parásito, lo cual resulta clave para comprender las variaciones entre sus distintas cepas y sentar las bases para el perfeccionamiento de diagnósticos y el diseño de tratamientos más efectivos. El avance fue liderado por Carlos Buscaglia, investigador del CONICET en el Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIBIO, CONICET-UNSAM) y en la Escuela de Bio y Nanotecnología (EByN), junto a Virginia Balouz, investigadora de las mismas instituciones.
El genoma del Trypanosoma cruzi presenta una organización particular dividida entre regiones "core", compuestas por genes esenciales conservados a lo largo del proceso evolutivo, y regiones "disruptivas", donde se ubican los factores de virulencia involucrados en el proceso de infección y en la evasión de las defensas del organismo humano. Durante décadas, el abordaje del genoma disruptivo representó un desafío técnico complejo para la comunidad científica global, dado que cada laboratorio recurría a metodologías y criterios propios de interpretación para clasificar las secuencias genéticas. Esta falta de estandarización generaba sesgos y dificultaba la comparación objetiva de los resultados entre distintas investigaciones.
Frente a esa problemática, el diseño de GCanner permitió automatizar la identificación de las áreas "core" y "disruptivas" a partir de las secuencias genómicas brutas, sin necesidad de realizar el proceso manual de anotación o interpretación previa. Esta metodología de "dividir y conquistar" facilita la subdivisión de un objeto de estudio complejo en segmentos más simples basados en la composición genómica, optimizando la reproducibilidad de los estudios y el análisis comparativo entre laboratorios de todo el mundo.
Este desarrollo se apoya en un hito previo alcanzado en 2025 por los mismos especialistas, quienes, en colaboración con investigadores del Instituto Pasteur de Montevideo, lograron descifrar y publicar en Scientific Reports el genoma completo de la cepa autóctona RA del parásito. Dicha cepa constituye el modelo experimental de referencia para el estudio de las manifestaciones más severas de la enfermedad en la región. El mapa genético de alta resolución obtenido reveló la presencia de aproximadamente 17 mil genes compartidos con otros parásitos emparentados y unos 7 mil genes de factores de virulencia exclusivos de este patógeno, cuya localización precisa puede determinarse de forma automática gracias al uso de GCanner.
